Расшифровка генома саламандры раскрыла секрет отращивания нового хвоста
Исследователи из Каролинского института составили карту генома иберийского ребристого тритона и выяснили, как состав и структура ДНК связаны с его способностью восстанавливать части тела. Статья опубликована в журнале Cell Genomics.
Саламандры известны своей уникальной способностью восстанавливать поврежденные и полностью потерянные части тела, а также устойчивостью к развитию опухолей. Молекулярные механизмы, лежащие в основе этих свойств, было трудно изучать из-за недостатка информации о составе их генома. Исследователям из Каролинского института удалось составить карту генома иберийского ребристого тритона, что позволило по-новому взглянуть на удивительные способности пресмыкающихся.
«Мы составили карту генома иберийского ребристого тритона, объём ДНК которого в шесть раз больше, чем у человека. Он содержит короткие некодирующие последовательности, повторяющиеся по всему геному. Это было технически сложной задачей, но нам удалось составить подробную карту, которая является более полной, чем у любого другого вида с аналогичным размером генома», — говорит Андраш Саймон, профессор кафедры клеточной и молекулярной биологии.
Используя передовые методы секвенирования, исследователи смогли определить точное расположение как кодирующих, так и некодирующих последовательностей в каждой хромосоме. Это дало им представление о том, как определённые некодирующие последовательности ДНК формируют состав генома и как они регулируются при восстановлении конечностей и хвоста.
«Мы определили, какие гены, кодирующие белки, отсутствуют в геноме саламандры или имеют больше копий, чем у других видов. Полученные результаты являются важным ресурсом для исследователей в нескольких областях, таких как эволюция генома, регенеративная способность и биология развития, а также биология рака», — объясняет Кетан Мишра, аспирант лаборатории Саймона на том же факультете.
Следующий этап исследования — сосредоточиться на функциональных исследованиях, в ходе которых ученые будут управлять молекулярными процессами, чтобы определить, как они влияют на способность к регенерации. Они также планируют провести сравнительные исследования с другими видами рептилий, чтобы лучше понять эти механизмы.h
