Представляем новые возможности GPT‑Rosalind

Интеграция более глубокого интеллектуального потенциала, опирающегося на реальные научные рабочие процессы в индустрии наук о жизни.

Запросить доступ

Мы представляем новое обновление модели в нашей серии GPT‑Rosalind, созданной специально для исследований в области наук о жизни (life sciences) в масштабах предприятия. Она объединяет возможности GPT‑5.5 по написанию кода с помощью агентов и использованию инструментов с улучшенным интеллектуальным потенциалом модели в ключевых областях разработки лекарств, таких как медицинская химия и геномика, одновременно повышая производительность в более широких областях анализа, проектирования и экспериментальных рабочих процессов в науках о жизни.

Прогресс в науках о жизни зависит от синтеза данных и фактических материалов в различных масштабах и модальностях: молекулы, гены, пути и живые системы. Согласно нашим оценкам, обновленная GPT‑Rosalind демонстрирует широкое повышение производительности в исследовательских задачах от экспертов в области биологии, при решении сложных запросов по медицинской химии, в количественной биологии и при устранении неполадок в «мокрых» лабораториях.

GPT‑Rosalind теперь доступна в рамках исследовательского превью для подходящих организаций по всему миру через нашу структуру развертывания с доверенным доступом.

Повышение эффективности решения задач, имеющих научную ценность

Чтобы измерять и непрерывно улучшать реальное влияние GPT‑Rosalind, мы разработали LifeSciBench — бенчмарк с внешней экспертной оценкой, ориентированный на фундаментальные аспекты исследований в области наук о жизни. В отличие от существующих бенчмарков, которые оценивают отдельный компонент производительности модели или изолированную биологическую область, LifeSciBench использует комплексный подход к научно ценной работе, объединяя задачи из шести ключевых областей рабочих процессов в науках о жизни: работа с данными, анализ, проектирование и оптимизация, научное обоснование, валидация и операции, а также трансляция и коммуникация. Мы используем этот бенчмарк для согласования прогресса с потребностями и реалиями исследований в области наук о жизни.

GPT‑Rosalind лидирует по производительности в задачах, имеющих научную ценность, определенных экспертами индустрии и академического сообщества.

Более сильное научное обоснование

Медицинская химия

GPT‑Rosalind достигает лидирующих в отрасли показателей производительности в медицинской химии — области, сфокусированной на превращении молекул в полезные лекарства. Мы разработали MedChemBench, чтобы отразить реалистичные рабочие процессы медицинской химии, оценивая мультимодальное понимание химических структур; соотношение «структура — активность» (SAR); прогнозирование эффективности, токсичности и параметров ADME (абсорбция, распределение, метаболизм, выведение) лекарственных средств; принятие решений по многопараметрической оптимизации лигандов;, а также ретросинтез. GPT‑Rosalind превосходит GPT‑5.5 с показателем 27,5% против 25,1% на бенчмарке MedChemBench, используя при этом на 7,2% меньше токенов.

GPT‑Rosalind демонстрирует лучший мультимодальный синтез и механистическое рассуждение в медицинской химии.

Геномика и количественная биология

В GeneBench — нашей агентной оценке долгосрочного сквозного анализа в геномике и количественной биологии — GPT‑Rosalind использует на 31% меньше токенов, чем GPT‑5.5, достигая при этом более высокой точности: 21,6% против 20.4%. GeneBench оценивает производительность агентов в долгосрочных количественных задачах: опираясь на реалистичные научные данные, способен ли агент спланировать валидный анализ, контроль качества (QC), моделирование и исправления для получения ответов, имеющих решающее значение для принятия решений? Включенные задачи охватывают различные области, включая функциональную геномику, пространственную транскриптомику, протеомику, эпигеномику и прикладную генетику.

GPT‑Rosalind использует на 31% меньше токенов, чем GPT‑5.5, одновременно повышая точность.

Помощь в работе реальных лабораторий

Мы представляем новый метод оценки для проверки способности GPT‑Rosalind помогать ученым, проводящим лабораторную работу в реальном мире. LabWorkBench проверяет способность модели связывать возмущения с результатами экспериментов в реальных протоколах «мокрых» лабораторий, используемых учеными, для целей от поиска и устранения неисправностей до оптимизации. Данные, используемые LabWorkBench, являются проприетарными и, следовательно, «чистыми» (незагрязненными). GPT‑Rosalind набирает 63,2% против 55,8% у GPT‑5.5, используя при этом на 5,3% меньше токенов.

При оказании помощи в протоколах реальных «мокрых» лабораторий GPT‑Rosalind демонстрирует значительный прирост по сравнению с GPT‑5.5, одновременно повышая эффективность использования токенов.

От рассуждений к выполнению рабочих процессов

Мы создали плагины Life Sciences Research и Life Sciences NGS Analysis, чтобы расширить возросший интеллектуальный потенциал модели GPT‑Rosalind практическим уровнем выполнения для повторяемых научных рабочих процессов. Вместе эти плагины объединяют поиск первоисточников данных, биологическую интерпретацию и выполнение биоинформатического анализа в едином рабочем пространстве, помогая исследователям связывать внешние данные с внутренними омиксными анализами при сохранении артефактов и происхождения (provenance). Теперь все пользователи могут получить доступ к обоим плагинам через Codex. Квалифицированные корпоративные пользователи GPT‑Rosalind могут дополнительно использовать GPT‑Rosalind для поддержки этих плагинов.

Чтобы более эффективно использовать Codex в качестве динамичного рабочего пространства для ученых, мы добавили интерактивные просмотрщики для биологически нативных типов файлов. Первоначальный набор просмотрщиков последовательностей, выравниваний и структур создан для того, чтобы ученые оставались в тесном контакте с фактическими данными, пока GPT‑Rosalind производит рассуждения в рамках рабочего процесса, и могли напрямую отвечать на последующие вопросы, используя активный просмотрщик в контексте.

Демонстрация выше показывает эти возможности в действии под управлением GPT‑Rosalind. Мы следим за ученым, исследующим биопсию жидкой опухоли с целью выявления мутаций и других молекулярных изменений, которые могли бы помочь в выборе лечения. Плагин Life Sciences NGS Analysis превращает обзор обработанных записей циркулирующей опухолевой ДНК (ctDNA) в интерактивный блокнот, выявляя повторяющиеся изменения, низкочастотные варианты и траектории образцов, которые концентрируют исследование на KRAS G12C. После этого плагин Life Sciences Research добавляет контекст по целевым мишеням, ингибиторам и резистентности на основе источников, в то время как нативные просмотрщики последовательностей, выравниваний и структур позволяют ученому напрямую изучить мутантный остаток 12, его консервативность в семействе RAS и карман связывания ингибитора. Рабочий процесс завершается переводом этих данных в конкретные варианты дальнейших действий, причем каждый шаг и артефакт доступны для экспертной оценки.

A computer screen shows a workspace instructing the use of an NGS Analysis plugin to explore ctDNA mutation data. The screen includes several bar charts labeled

Плагин Life Sciences NGS Analysis

Контроль качества (QC) и аннотирование scRNA-seq

Screenshot of a split-screen bioinformatics workflow. The left panel shows an AI assistant summarizing a completed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) quality-control analysis, including generated files, QC metrics, UMAP visualizations, and cell-type annotations. The right panel displays an

Превратите набор матриц в стиле 10x в отфильтрованные по контролю качества артефакты отдельных клеток, аннотации и UMAP-графики, которые вы можете изучать и дорабатывать в Codex. Плагин Life Sciences NGS Analysis направляет запрос к scrna-seq-qc, выбирает пороговые значения контроля качества на основе данных, сохраняет информацию о происхождении в отношении фильтрации и аннотирования, а также выявляет препятствия, такие как отсутствие зависимостей для обнаружения дублетов.

Контроль качества FASTQ для полнотранскриптомного секвенирования (Bulk RNA-seq)

Split-screen view of an RNA-seq workflow: an AI assistant summarizes completed bulk RNA-seq quality-control results on the left, while an interactive MultiQC report with sequencing statistics and Salmon metrics is displayed on the right.

Превратите таблицу образцов bulk RNA-seq, набор файлов FASTQ и референсные файлы в проверенный по качеству набор счетчиков (counts bundle), который вы можете изучать и повторно использовать в Codex. Плагин Life Sciences NGS Analysis направляет запрос, проверяет входные данные и возвращает проверяемый пакет выполнения с MultiQC, матрицами Salmon, информацией о происхождении и явными примечаниями о нюансах (caveats).

Расширенный доступ для доверенных организаций

Мы расширяем доступ к серии GPT‑Rosalind для соответствующих критериям организаций по всему миру. GPT‑Rosalind будет доступна в рамках ознакомительной исследовательской версии через нашу структуру развертывания с доверенным доступом для организаций, которые проводят легитимные научные исследования с очевидной общественной пользой, обладают надежным управлением и контролем безопасности, а также обеспечивают контролируемый доступ с защитой корпоративного уровня.

В рамках этого глобального расширения мы рады поддержать миссию компании Novo Nordisk по более быстрому предоставлению пациентам инновационных вариантов лечения за счет масштабирования ее медицинских исследований с помощью GPT‑Rosalind. Novo Nordisk использует передовые возможности искусственного интеллекта, чтобы помогать исследователям анализировать сложные наборы данных, выявлять полезные закономерности и быстрее проверять гипотезы. Более глубокое понимание биологических процессов моделью GPT‑Rosalind поможет командам объединять данные из литературы, геномики, транскриптомики, сиквенсов, структур и экспериментальных результатов, упрощая переход от данных к более четким исследовательским решениям.

«Исследования в области наук о жизни сложны, насыщены данными и междисциплинарны. Чтобы приносить реальную пользу исследователям, передовые модели ИИ должны опираться на проверенные научные данные, быть связаны с проверенными инструментами и интегрироваться в те реальные рабочие процессы, которые исследователи используют каждый день. Мы довольны нашим партнерством с OpenAI и возможностью изучить, как GPT‑Rosalind может способствовать более строгим и практичным подходам к разработке лекарств».

Мишал Патель (Mishal Patel), вице-президент группы по искусственному интеллекту и цифровым инновациям в сфере НИОКР, Novo Nordisk

Теперь мы также предлагаем рабочее пространство под управлением OpenAI для квалифицированных организаций, у которых нет корпоративного аккаунта (Enterprise).

  • Запросить доступ

Что дальше

Обновленная версия GPT‑Rosalind — это следующий шаг в рамках нашего более широкого стремления создавать системы искусственного интеллекта, которые могут способствовать ускорению научных открытий, одновременно гарантируя, что передовые биологические возможности развертываются с соблюдением надлежащих мер безопасности. Мы продолжим совершенствовать биологические рассуждения модели, расширять поддержку сложных исследовательских рабочих процессов с интенсивным использованием инструментов и долгосрочным планированием, а также сотрудничать с квалифицированными организациями в различных регионах для оценки реального воздействия.

Это также означает применение ИИ в области наук о жизни для решения масштабных задач на благо общества: от разработки лекарств и трансляционной медицины до общественного здравоохранения, готовности к чрезвычайным ситуациям и биобезопасности. С помощью Rosalind Biodefense и нашей модели развертывания с доверенным доступом мы стремимся предоставить передовые биологические возможности в руки исследователей, учреждений и специалистов по защите, которые работают над улучшением здоровья человека и укреплением устойчивости общества.

Мы продолжим совершенствовать GPT‑Rosalind, чтобы она стала более эффективным партнером на всех этапах жизненного цикла научных исследований, помогая ученым быстрее переходить от правильных вопросов к более надежным доказательствам, качественным экспериментам и, в конечном итоге, к новым методам лечения для пациентов.

Полный текст статьи читайте на OpenAI