Российские ученые получили грант Microsoft Research для изучения генетических заболеваний
Группа ученых Института цитологии и генетики СО РАН и Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН стала одним из победителей международного конкурса Microsoft Azure for Research и получила грант на использование облачной платформы Microsoft для проведения научных исследований. Windows Azure позволит упорядочить все имеющиеся данные многолетних исследований российских и зарубежных генетиков, что впоследствии даст возможность понять причины возникновения и развития болезни Альцгеймера и других генетических заболеваний.
Генетики под руководством академика Николая Александровича Колчанова (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск) профессора Евгения Ивановича Рогаева (Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, Москва) изучают молекулярно-генетические механизмы возникновения таких распространенных заболеваний, как, например, диабет и болезнь Альцгеймера. Задача исследователей — определить группы генов, вовлеченных в формирование конкретных заболеваний, выявить закономерности их изменчивости и дать ученым, работающим в области медицины и молекулярной генетики, базу для дальнейших исследований.
За время работы над проектом было собрано большое количество информации о генетическом разнообразии человека, о генах, потенциально вовлеченных в формирование заболеваний человека, взаимодействиях между ними, а также о влиянии на них факторов внешней среды. Это своего рода «генетическая архитектура заболеваний», выявление которой является важнейшей задачей генетики человека и биомедицины. Ее решение даст возможность оценки предрасположенности к заболеваниям, их ранней диагностики на основе анализа индивидуальных особенностей геномной организации и выбора оптимальной стратегии лечения. Перенос мультиструктурных массивов данных в облако от Microsoft позволит упорядочить террабайты информации, оперативно получать из нее новые знания, кардинально сокращая время, необходимое для исследований.
«Партнерство с компанией Microsoft является нашим стратегическим выбором, — рассказывает академик Н.А. Колчанов. — В рамках предыдущих соглашений с Microsoft нами выполнена определенная работа, которая имеет большие перспективы для дальнейшего сотрудничества. В частности, в 2013 г. были проанализированы возможности использования облачной платформы Microsoft для проведения научных исследований в области персонализированной медицины, включая анализ влияния однонуклеотидных полиморфизмов (SNPs — Single Nucleotide Polymorphisms) на функцию генов, связанных с развитием социально-значимых заболеваний человека». По словам академика Н.А. Колчанова, предоставление компанией Microsoft гранта на использование мощностей Windows Azure принципиально меняет скорость и глубину реализуемых учеными исследований.
«Работы участников конкурса Windows Azure for Research оценивались по двум основным параметрам — возможности их развертывания на Windows Azure и тому, насколько она может ускорить процесс исследований, — сказал Дэрон Грин, директор по региональным исследованиям Microsoft Research. — Облачная платформа Microsoft позволяет управлять данными любого объема и извлекать из них новые знания, которые могут стать основой для новых грандиозных научных открытий».
Microsoft Research впервые проводит международный конкурс грантов Windows Azure for Research среди ученых, которые работают над социально-значимыми проектами в медицине, геологии, экологии, геномике и других фундаментальных дисциплинах. Победители конкурса получат возможность пользоваться Windows Azure в течение года.
Информация о проекте
«Идентификация генов, ответственных за функции и патологии мозга, на основе экспериментального исследования и биоинформатической реконструкции генных сетей нейробиологических процессов»
В рамках мегапроекта «Идентификация генов, ответственных за функции и патологии мозга, на основе экспериментального исследования и биоинформатической реконструкции генных сетей нейробиологических процессов», возглавляемого профессором Е.И. Рогаевым, в ИЦиГ СО РАН и ИОГЕН РАН ведется важная для персонализированной медицины работа по компьютерной реконструкции генных сетей нейробиологических систем и процессов, вовлеченных в формирование депрессивных расстройств, болезни Альцгеймера, нарушений метаболизма. В решении задач биоинформатики ученые сотрудничают с IT компанией ООО НЦИТ «УНИПРО», которая имеет опыт работы с Azure и другими средствами поддержки облачных технологий, а также с Новосибирским государственным университетом, выигравшем конкурс на создание Центра прорывных исследований в области информационных технологий: наукоёмкое программное обеспечение и биоинформатика (научные координаторы Центра — академик Н.А. Колчанов и сотрудники ИВМиМГ СО РАН чл.-корр. РАН С.И. Кабанихин и к.т.н. Ю.М. Зыбарев). В настоящее время ИЦиГ СО РАН, ИОГЕН РАН, ООО НЦИТ «УНИПРО», НГУ и ИВМиМГ СО РАН формируют программу совместных исследований по реализации создаваемых программных продуктов в виде облачных сервисов на основе Microsoft Azure для решения задач персонализированной медицины. В рамках этой программы будут проводиться исследования, направленные на создание облачной информационной среды для биоинформатики, компьютерной системной биологии и персонализированной медицины, в т.ч. — создание специализированных сервисов на основе облачных технологий, которые обеспечат анализ больших объемов биологических данных, извлечение биомедицинских знаний из слабоструктурированных и текстовых источников и предоставление их пользователям в удобном виде, конструирование и анализ масштабируемых моделей молекулярно-генетических систем и, тем самым, быстрое решение задач персонализированной медицины.
Информация о Microsoft
Research
Исследовательское подразделение корпорации Microsoft — Microsoft Research было основано в 1991 году. Основной сферой деятельности подразделения являются фундаментальные и прикладные исследования в области вычислительной техники и разработки программного обеспечения по таким направлениям, как графика, распознавание речи, исследования пользовательского интерфейса, повышение персональной производительности, обработка естественных языков, программные инструменты и методики, операционные системы и сетевые приложения, а также математические дисциплины.
В Microsoft Research работает более 800 человек в 6 научно-исследовательских центрах, находящихся в Редмонде (штат Вашингтон); Кремниевой Долине (Калифорния); Кембридже (Великобритания); Пекине (Китай) и Бангалоре (Индия). Microsoft Research сотрудничает с научными и исследовательскими центрами, а также колледжами и университетами по всему миру с целью улучшить методику преподавания и обучения, вдохновлять технологические инновации и широко распространять исследования в области вычислительной техники.
Дополнительную информацию о Microsoft Research вы можете получить по адресу:
http
://
www
.
research
.
microsoft
.
com
.
Вы также можете обратиться с вопросами к PR-менеджеру Microsoft Тамиле Оганезовой a-taogan@microsoft.com или к координатору программ в России Елене Павловой v-elpavl@microsoft.ru.
Источник: Microsoft
