В нашем рту скрываются загадочные огромные фрагменты ДНК: зачем они нужны
О том, что в нашей ротовой полости живут миллиарды бактерий, известно давно. Эти микроорганизмы могут как помогать нам, так и вредить нашему здоровью. Однако специалисты из Токийского университета обнаружили среди этих бактерий ранее неизвестные объекты — гигантские фрагменты ДНК, которые существуют отдельно от основного генома микробов.
Эти фрагменты получили название «иноклы» — это сокращение от английского словосочетания insertion sequence encoded; oral origin; circle genomic structure. Руководитель исследования Юя Кигучи объясняет: «Такие элементы широко встречаются в окружающей среде, микробиоме или патогенах. Но мы не знали ни одного примера присутствия таких фрагментов ДНК среди микробов, которые живут в симбиозе с нашим организмом».
Анализ образцов слюны сотен людей показал, что иноклы присутствуют примерно у 74% людей. Интересно, что обнаружить их из-за технических ограничений удалось только сейчас. Традиционные методы секвенирования ДНК разрезают генетический материал на мелкие кусочки для анализа, что не позволяет увидеть настолько крупные структуры. Только применение более дорогого и трудоемкого метода секвенирования, который работает с большими фрагментами ДНК, не разрезая их позволил сделать это открытие.
Сопоставив полученные генетические данные с анализами крови тех же людей, ученые обнаружили поразительно четкую связь между уровнем иноклов и особенностями работы иммунной системы, включая иммунный ответ на некоторые бактериальные и вирусные инфекции. Еще более интригующим оказалось то, что у 68 участников исследования, страдавших раком головы, шеи или толстого кишечника и прямой кишки уровень иноклов в ротовой полости был заметно ниже, чем у здоровых людей. Это значит, что иноклы можно использовать как биомаркеры для диагностики онкологических заболеваний в будущем.
Флойд Дьюхерст, профессор института ADA Forsyth, не принимавший участия в исследовании, считает, что открытие представляет собой «новый кусочек головоломки, который является важным шагом для понимании роли и функций орального микробиома в поддержании здоровья человека и возникновении у него болезней». По словам специалиста, теперь, когда о существовании иноклов стало известно, можно попытаться выяснить их функции и потенциальную роль в поддержании здоровья или развитии заболеваний.
Ранее ученые выяснили, что долголетие наследуется не только через гены.
