ИИ-агенты OpenAI проанализировали атлас генов мозга мыши за 32 минуты
- Почти 2 000 агентов на GPT-Rosalind проанализировали данные атласа CRISPR мозга мыши за 32 минуты; вручную это заняло бы месяцы или год.
- В слепых тестах эксперты предпочли распределённые отчёты отчётам одного агента в 75% случаев; при максимальной нагрузке агенты сослались более чем на 700 публикаций против 11.
- Отключение Tsc2 изменило работу десятков генов, связанных с передачей сигналов в клетках мозжечка; отключение Tsc1 почти ничего не изменило.
Почему это важно: Эта разница может иметь значение для туберозного склероза — редкого генетического заболевания.
OpenAI, PerturbAI и Scripps Research использовали почти 2 000 ИИ-агентов, чтобы за 32 минуты проанализировать большой массив данных о мозге мыши.
По оценке команды, исследователям, работающим вручную, на тот же анализ потребовались бы месяцы или даже год. OpenAI опубликовала его результаты в среду.
Агенты работали на модели GPT-Rosalind от OpenAI, разработанной для исследований в области биологических наук. Результаты изложены в препринте на bioRxiv, который ещё не прошёл рецензирование.
Данные взяты из атласа CRISPR всего мозга, созданного PerturbAI. CRISPR — это инструмент для редактирования генов. В данном случае его использовали, чтобы отключать отдельные гены у мышей и выяснять, как каждое изменение влияет на разные типы клеток мозга.
Каждому агенту поручили изучить одно из таких изменений генов. Он анализировал реакцию клеток, искал сведения в научной литературе и предлагал возможные объяснения.
Затем команда объединила все отчёты в единый атлас рассуждений, связывающий гены, воздействие на клетки, научные публикации и вероятные механизмы.
По данным OpenAI, агенты воспроизвели результаты предыдущих исследований, проведённых людьми, а также обнаружили новые зацепки. В слепых тестах эксперты в 75% случаев предпочли отчёты, подготовленные таким распределённым методом, отчётам одного агента.
Распределённый метод также охватывал более широкий круг источников. При самой масштабной нагрузке агенты вместе сослались более чем на 700 публикаций, тогда как один агент — на 11.
Одна из зацепок связана с двумя генами — Tsc1 и Tsc2, которые помогают контролировать рост клеток. Отключение Tsc2 изменило работу десятков генов, связанных с передачей сигналов между нервными клетками мозжечка, тогда как отключение Tsc1 практически ничего не изменило. Эта разница может иметь значение для туберозного склероза — редкого генетического заболевания.
В другом случае отключение Dctn1 — гена, связанного с редким заболеванием мозга, синдромом Перри, — повысило активность генов, отвечающих за выработку холестерина. Агенты предложили лабораторные эксперименты, которые помогут проверить, влияет ли это на повреждение нервных клеток.
«Мы создаём клеточные атласы, чтобы другие учёные могли совершать открытия, о которых мы пока даже не догадываемся», — сказала Сара Тайхманн, профессор медицины стволовых клеток в Кембриджском университете.
Атлас рассуждений уже доступен на GitHub, а исходный набор данных опубликован на Hugging Face.
