Скрипт по биоинформатике от ChatGPT работает с первого раза

На интенсиве по анализу NGS-данных Бластима идет практика по транскриптомике. Участник курса после практического занятия попросил ИИ-бот ChatGPT написать скрипт для обработки данных РНК-секвенирования…

…с триммингом, QC до и после тримминга…

a1138d08adbcf2ec4d8cb50702e0e1cc.jpg

…и подсчетом прочтений на референсный транскриптом с учетом нескольких повторностей.

ae49d623ecc8eda6778dc64bb6d3017e.jpg

С триммоматиком алгоритм немного намудрил.

eb697f1652596b47de37fac835b4edf5.jpg

Поэтому участник попросил его убрать.

0ddf9d923c6f7c029f30b066edafbfd8.jpg

Но за пару запросов это наверняка возможно будет поправить.

5b1b57089610da29e604217a703078bf.jpg

В итоге удалось дойти до оценки дифэкспрессии.

0a9011789c5197c68a9dd0067f47cb9e.jpg

«Первый раз пробовал chatGPT, я впечатлен!» — пишет наш студент.

8e7a4b454ed27c2535d07c4868efa66a.jpg

А вы уже пробовали использовать ChatGPT для решения задач в работе или учебе?)

© Habrahabr.ru