OpenWorm — международный проект по созданию компьютерной модели червя
OpenWorm — попытка построить полную симуляцию червя, состоящего из 302 нервных клеток и 95 мышечных.Проект стартовал в начале 2011 года и в настоящее время продолжает свое существование с помощью сотрудничества ученых и программистов из США, России и Европы. Все усилия рассматриваются как первый шаг на пути к имитации больших биологических систем. Для построения модели взят червь C. elegans.Биология червя C. elegansCaenorhabditis elegans, как правило, сокращенно C. elegans, является свободноживущей нематодой (круглый червь) длинной около 1 мм. C. elegans является один из самых простых организмов с нервной системой. Червь живет в умеренных условиях почвы и питается бактериями. Исследования этого вида в молекулярной биологии и биологии развития начались в 1974 работами Сиднея Бреннера. Широко используется как модельный организм в исследованиях по генетике, нейрофизиологии, биологии развития, вычислительной биологии.
Проект OpenWorm
OpenWorm рассматривается не просто как модель, а как первая искусственная форма жизни. Цель состоит в том, чтобы создать полную, биологически реалистичную эмуляцию червя, от генов к поведению путем построения модели тела, нервной системы, а также окружения червя. Мотивацией проекта является то, что только путем воссоздания организма он может быть понят. C. elegans был выбрана потому, что он является одним из самых маленьких и наиболее изученных животных в биологии. Если проект будет иметь успех, в будущем можно будет имитировать более сложные формы жизни. На 2014 год были созданы модели нейронного коннектома и мышечных клеток. На сайте проекта доступен трехмерный интерактивный анатомический атлас червя. Участники проекта OpenWorm также развивают платформу geppetto, предназначенную для моделирования целых организмов.
[embedded content]
