Нейросеть AlphaFold предсказала трехмерную структуру всех белков человека
DeepMind и Европейский институт биоинформатики опубликовали базу данных из более чем 350 тысяч трехмерных белковых структур, которые предсказала нейросеть AlphaFold. ИИ смог определить примерную трехмерную структуру всех 20 тыс. белков, которые синтезируются в клетках человека.
Также в базе данных присутствуют протеомы других организмов — рыбок данио, бактерий кишечной палочки, мушек-дрозофил, червей-нематод и дрожжей. Со временем ученые планируют добавить еще сотни миллионов структур.
Как заявил генеральный директор DeepMind Демис Хассабис, база данных сможет стать ценным ресурсом для разработки новых лекарств и понимания болезней.
Успех использования AlphaFold зависит от того, насколько точны ее прогнозы. Как показали первые испытания нейросети, она способна определять положение аминокислот внутри молекулы белка точностью до атомов. В ходе тестов AlphaFold точно определила структуру более 98,5 процентов белков.
В прошлом году нейросеть стала лидером в соревновании по предсказанию структуры белков Critical Assessment of protein Structure Prediction (CASP), для победы в котором необходимо не менее 95 процентов точности определения местоположения отдельных атомов в белке.
AlphaFold позволила получить структуры белков, связанных с рядом болезней, включая диабет и синдром Вольфрама. В будущем ученые надеются расширить базу и добавить в нее трехмерную структуру всех белков, известных науке, что поможет лучше понимать устройство живых организмов и изучать нарушения в их работе.
